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ncbi的使用教程如下:
1、首先进入NCBI主页。
Map view演示,主要是找到相关基因在染色体上的位置,以人类IL-6基因为例。点击Map View
2、选择物种,点击Go;设置filter,过滤信息;点击Genes seq查询序列
3、最后进入序列下载页面,可以直接下载。可以选择多种格式,一般选择fasta。
4、通过clone查询相关基因的cDNA序列,选择clone数据库,search基因描述。
5、对基因的蛋白质序列和mRNA查询。
6、也可对序列进行查询。基因组展示。
7、也可以查询序列信息。
8、查询已知引物,通过probe数据库搜索。
9、同源性比对blast。有多种比对方式。DNA,RNA,Protein等比对模式,排列越高表示同源性越强。也可以进行引物比对。
知识拓展
NCBI是National Center for Biotechnology Information的缩写,指美国国家生物技术信息中心,建立于1988年。
NCBI的初衷是为了给分子生物学家提供一个信息储存和处理的系统。除了建有GenBank核酸序列数据库(该数据库的数据资源来自全球几大DNA数据库,其中包括日本DNA数据库DDBJ、欧洲分子生物学实验室数据库EMBL以及其它几个知名科研机构)之外,NCBI还可以提供众多功能强大的数据检索与分析工具。
DDBJ:DNADataBaseofJapan是日本人建立的核酸数据库;NCBI中的Genbank是美国建立的核酸数据库;EMBL是欧洲建里的核酸数据库;这三个数据库是连通的,数据共享。
1、数据库定义:数据库,又称为数据管理系统,简而言之可视为电子化的文件柜——存储电子文件的处所,用户可以对文件中的资料执行新增、截取、更新、删除等操作。
它是以一定方式储存在一起、能与多个用户共享、具有尽可能小的冗余度、与应用程序彼此独立的数据集合。一个数据库由多个表空间构成。
SRA是NIH的高通量测序数据的主要档案,是国际核苷酸序列数据库协作(INSDC)的一部分,包括NCBI序列阅读档案(SRA),欧洲生物信息学研究所(EBI)和DNA数据库。 日本(DDBJ)。 提交给三个组织中任何一个的数据在它们之间共享。
美国的核酸数据库GenBank 欧洲核酸序列数据库EMBL 日本核酸序列数据库DDBJ 这是目前世界三大核酸数据库.不本我们用的最多的还是NCBI,基本上是不用日本的!
生物信息学专业人士可以通过考取各种认证来提升职业技能和信誉。推荐的认证包括:生物信息学认证委员会 (CBBI) 颁发的生物信息学认证专业人员 (CBP)国际计算生物学会 (ISCB) 颁发的欧洲注册生物信息学家 (EURBI)美国国家生物信息学研究中心 (NCBI) 颁发的生物信息学认证计划 (BCA) 这些认证表明了对生物信息学理论和实践的深入理解,并有助于专业人士在竞争激烈的领域中脱颖而出,证明其能力和专业知识。
生物技术专业可以考基因测序实验工程师、遗传咨询师、生物信息分析工程师,随着二代测序技术的快速发展,这部分人才缺口比较大。目前来说生物信息学考到证书后还是比较好就业!
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这个问题涉及三个方面。
一、目前为止不存在人工合成的问题。有这样的传言,最早印度有人提出是中国合成的,马上自己就收回了。后来美国有人怀疑是德特里克堡陆军传染病研究所出的问题,该所去年7~8月被美CDC勒令关闭,无人可以深入调查无法追究,暂时打住了。要较真的话,值得探究!最近美国爆出武汉病毒研究所和P4实验室的问题,属于没有任何依据的谣言,还是由美参议院汤姆. 科顿提出。我国这两个单位都还正常运行。多数科学家都认为自然界病毒的面大,而且病毒的源头不在武汉。
二、SARS冠状病毒的天然宿主很可能是蝙蝠,新冠病毒是新冠状病毒,现在知道它致命性不如SARS,但是传染性超强。
三、艾滋病毒是通过血液传染或不洁性交传染,传染途经不同,有说是从非洲黑猩猩体内病毒变异而来,主要破坏人体免疫系统,最早在美国被发现。
总之,新冠病毒引发肺炎,致命性不如SARS,但对人体免疫系统有伤害,与其他基础性疾病叠加,病死率增高,传染性强,在无明显症状的潜伏期也具有传染性,人工合成生物武器的说法只是说法而已。
不是呀,冠状病毒自然界早就存在。目前已知有6种冠状病毒,这次感染人类是最新的一种。我国早在1月份就向全世界公布了冠状病毒基因序列,所以病毒不可能是人造的,而是自然的产物。大多数专家认为病毒来自蝙蝠、穿山甲一类动物。至于最近有科学家研究发现冠状病毒基因里有艾滋病毒片断,其实只是相似,而非肯定就是。
病毒从病毒研究所泄露,从而引发人类感染,造成疫情流行,这种事情在全世界到有的,包括咱们国家。
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